Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sall3Q62255 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms