Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga6Q61739 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms