Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms