Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf1Q61069 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usf1Q61069 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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