Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd6Q61003 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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