Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms