Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms