Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Slc6a4Q60857 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Slc6a4Q60857 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Slc6a4Q60857 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Slc6a4Q60857 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Slc6a4Q60857 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Slc6a4Q60857 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Slc6a4Q60857 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Slc6a4Q60857 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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