Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stxbp3Q60770 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms