Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atf3Q60765 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms