Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim38Q5SZ99 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim38Q5SZ99 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim38Q5SZ99 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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