Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsr1Q5SWD9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms