Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp18Q5SSI6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms