Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf12Q5SPL2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phf12Q5SPL2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms