Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xirp2Q4U4S6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xirp2Q4U4S6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms