Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc3lQ4KL14 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms