Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Prdm6Q3UZD5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Prdm6Q3UZD5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Prdm6Q3UZD5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Prdm6Q3UZD5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Prdm6Q3UZD5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Prdm6Q3UZD5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prdm6Q3UZD5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Prdm6Q3UZD5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Prdm6Q3UZD5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prdm6Q3UZD5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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