Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Skap2Q3UND0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms