Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms