Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cog7Q3UM29 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cog7Q3UM29 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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