Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms