Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms