Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nkx6-3Q3UHX8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nkx6-3Q3UHX8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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