Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Arfgef3Q3UGY8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Arfgef3Q3UGY8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Arfgef3Q3UGY8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Arfgef3Q3UGY8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Arfgef3Q3UGY8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Arfgef3Q3UGY8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Arfgef3Q3UGY8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Arfgef3Q3UGY8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Arfgef3Q3UGY8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arfgef3Q3UGY8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms