Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nom1Q3UFM5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nom1Q3UFM5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nom1Q3UFM5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nom1Q3UFM5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nom1Q3UFM5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nom1Q3UFM5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nom1Q3UFM5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms