Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trafd1Q3UDK1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trafd1Q3UDK1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms