Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Q3U6N9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Q3U6N9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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