Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf149Q3U2C5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf149Q3U2C5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf149Q3U2C5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms