Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LcorlQ3U285 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms