Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Srsf6Q3TWW8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms