Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samd11Q1RNF8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd11Q1RNF8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms