Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms