Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Cers3Q1A3B0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Cers3Q1A3B0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cers3Q1A3B0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
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