Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam171bQ14CH0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam171bQ14CH0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms