Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms