Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms