Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps8Q0P5W1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms