Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms