Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ubxn2bQ0KL01 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms