Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata4Q08369 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms