Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Tgm3Q08189 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms