Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc2Q05020 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms