Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scg2Q03517 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scg2Q03517 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms