Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Thbs2Q03350 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms