Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb4Q02738 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms