Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ascl1Q02067 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms