Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd1Q01822 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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