Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cacna1cQ01815 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cacna1cQ01815 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms