Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Itga4Q00651 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms