Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoa1Q00623 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms